A origem da Base Aérea de Canoas remonta a 29 de março 1933 com a ativação do 3º Regimento de Aviação do Exército sediado em Santa Maria (RS).

Em 1935, ocorre o início de preparação do terreno, na localidade de Canoas, então município de Gravataí, para a construção de um campo de pouso e instações para a nova sede do 3 º Regimento de Aviação.

Em 1937, o 3° Regimento de Aviação é transferido para Canoas e ocupa o local, onde hoje se encontra o Quartel-General do Quinto Comando Aéreo Regional (V COMAR).

Em 20 de janeiro de 1941, com a criação do Ministério da Aeronáutica, o acervo de pessoal e material da Aviação Militar do Exército, transfere-se para a nova arma.

Finalmente, o Decreto-Lei 6814, de 21 de agosto de 1944, cria a Base Aérea de Canoas.

Em 1941, ela é extinta com a criação da base Aérea de Porto Alegre que ocupa as instalações construídas às margens do rio Gravataí, permanecendo até os dias atuais.

Em 21 de agosto de 1961, a Base Aérea de Porto alegre volta à denominação definitiva de Base Aérea de Canoas numa homenagem ao município que sempre acolheu e acolhe fraterna e amigavelmente, os militares que atuam nas organizações militares da  Força Aérea Brasileira.

A missão da Base é prosseguir no apoio às unidades sediadas, bem como aquelas eventualmente desdobradas no extremo sul do país.

Atualmente, a Base Aérea de Canoas é sede de cinco unidades:

1° Esquadrão do 14° Grupo de aviação (aviões F5 em fase de modernização);
5° Esquadrão  de Transporte Aéreo ( aviões Bandeirante);
2° Esquadrão do 1° Grupo de Comunicação e Controle;
Destacamento de Controle do Espaço Aéreo de Canoas, e
Batalhão de Infantaria da Aeronáutica Especial de Canoas.

Mantenedora de uma parcela considerável do poder aeroespacial brasileiro, a BACO orgulha-se de ser uma muralha inexpugnável da integridade territorial brasileira, constituindo-se na sentinela avançada da soberania nacional, tendo como lema,